Rhinogen? Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)具有穩定性高、比活性高等特點,是兩種高度純化和非常穩定的糖苷酶的組合,適用于蛋白質組學及糖生物學研究中糖蛋白上常見O-連聚糖的有效釋放。
高純度:沒有污染蛋白酶/其它糖苷酶,純度≥95%;
高穩定性:每批Kit試劑盒中酶及試劑都經過嚴格的質量控制,以實現高穩定性;
高比活性:有效釋放糖蛋白上唾液酸修飾O-連聚糖;
HPLC、MS兼容:試劑盒中所有的酶及試劑與下游HPLC及MS兼容。
背景:
Rhinogen? Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)包含O-Glycosidase及α2-3,6,8,9 Neuraminidase,二者均是重要的糖基化研究的工具酶,組合用于糖蛋白O-連糖鏈的酶切釋放。Rhinogen? O-Glycosidase能夠將糖蛋白中Ser或Thr殘基的羥基連接的Core 1(Gal-β(1-3)-GalNAc-)及Core 3(GlcNAc-β(1-3)-GalNAc-)O-連雙糖釋放下來,如圖1。核心結構的任何修飾都可以阻斷O-Glycosidase的作用,最常見的修飾是核心結構的單、二或三唾液酸化。Rhinogen? α2-3,6,8,9 Neuraminidase能夠釋放O-連糖鏈非還原末端α (2,3)-, α (2,6)-, α (2,8)-, α (2,9)-唾液酸殘基,如圖2,不同唾液酸殘基的釋放速率大致為α (2,6)->α (2,3)- >α (2,8)- >α (2,9)-。唾液酸酶的這種組合模式使得O-連糖鏈的酶切釋放更徹底。該Kit包含的所有酶及試劑均與下游HPLC及MS兼容。
圖1. O-Glycosidase與α2-3,6,8,9 Neuraminidase組合用于糖蛋白O-連糖鏈的酶切釋放
圖2. Rhinogen? α2-3,6,8,9 Neuraminidase作用位點
包裝規格:
Rhinogen? Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)包裝規格如下:
O-Glycosidase
α2-3,6,8,9Neuraminidase
1,200,000U
0.6U
30μl
30μl
目錄號
組成
規格
體積
QPF-008
配套試劑:
Rhinogen? Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)提供的配套試劑如下:
試劑
成分
10×Denaturing緩沖液
5%SDS,0.4M DTT
10×Glyco緩沖液2
0.5MSodium Phosphate(pH7.5 at 25°C)
10%NP-40溶液
10%NP-40
產品來源:
本試劑盒中的所有酶都是大腸桿菌BL21中表達并分離純化的重組酶:O-Glycosidase基因來源于Enterococcus Faecalis,分子量為147kDa;α2-3,6,8,9 Neuraminidase基因來源于Arthrobacter ureafaciens,分子量為66KDa。
產品質量:
SDS-PAGE分析,純度≥95%;沒有檢測到污染的糖苷外切酶、糖苷內切酶及蛋白酶活性。
酶活定義:
1個O-Glycosidase酶活力單位定義:在100 μl反應體系中,37°C,pH7.5條件下,1小時內從5mg唾液酸酶消化后的非變性fetuin 上催化釋放0.68nmol O-連二糖所需要的酶量。1U Rhinogen? O-Glycosidase =1 unit NEB O-Glycosidase。
1個α2-3,6,8,9 Neuraminidase酶活力單位定義:在37°C,pH5.5條件下,以對硝基苯基-α-D-N-乙酰神經氨酸為底物,1分鐘內催化釋放1 μmol 對硝基苯酚所需要的酶量。1U Rhinogen? α2-3,6,8,9 Neuraminidase =1 U Prozyme Glyko? Sialidase ATM。
儲存條件:
-20°C。
產品特點:
Rhinogen? Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)具有穩定性高、比活性高等特點,是兩種高度純化和非常穩定的糖苷酶的組合,適用于蛋白質組學及糖生物學研究中糖蛋白上常見O-連聚糖的有效釋放。
1. 高純度:沒有污染蛋白酶/其它糖苷酶,純度≥95%;
2. 高穩定性:每批Kit試劑盒中酶及試劑都經過嚴格的質量控制,以實現高穩定性;
3. 高比活性:有效釋放糖蛋白上唾液酸修飾O-連聚糖;
4. HPLC、MS兼容:試劑盒中所有的酶及試劑與下游HPLC及MS兼容。
應用:
1. 聚糖結構分析;
2. 結合位點及功能分析;
3. 治療性糖蛋白的表征及質量控制;
4. 蛋白質組學分析,消除糖蛋白的異質性。
使用建議:
變性條件下去糖基化方案:
1. 取10-100μg糖蛋白溶液,加入1μl 10×Denaturing緩沖液,補加純化水使得反應體系為10μl;
2. 將上述10μl體系100℃處理10min,使糖蛋白完全變性;
3. 室溫冷卻5min;
4. 在上述變性體系中,分別加入2μl 10×Glyco緩沖液2、2μl 10% NP-40溶液、1-4μl O-Glycosidase、1-2μl α2-3.6.8.9Neuraminidase,補加純化水至反應總體積為50μl,輕柔混勻;
5. 37°C 條件下反應1-5hr;
注意:對于不同的糖蛋白樣品,需要實驗摸索最適的酶濃度及反應時間。
非變性條件下去糖基化方案:
1. 取10-100μg糖蛋白底物溶液,加入2μl 10×Glyco緩沖液2、純化水及1-4μl O-Glycosidase、1-2μl α2-3.6.8.9Neuraminidase,使得總反應體積為20μl,輕柔混勻;
2. 37°C 條件下反應1-4hr。
注意:通常情況下,糖蛋白變性與否不顯著影響O-連糖鏈去除的效率,但也不排除個例,建議根據自己的底物特性,選擇合適的方法。
當對天然糖蛋白去糖基化時,建議將等量糖蛋白樣品進行變性后再同步進行酶切作為陽性對照,以確定非變性條件下去糖基化反應的程度。
操作說明:
1. 上述操作方法旨在為Rhinogen? Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)作為去糖基化試劑操作的一般指南,對于不同的糖蛋白樣品,去糖基化活性高度依賴于反應條件,建議進行適當優化或根據經驗確定最優的操作方法;
2. 去糖基化體系可以線性放大或縮小;
3. 由于變性緩沖液中含有SDS,而SDS會抑制Rhinogen? O-Glycosidase的活性,因此在變性糖蛋白反應體系中需加入終濃度為1%的NP-40,其能有效解除SDS對O-Glycosidase酶活的抑制;
4. 本產品適用于天然或者變性糖蛋白,對于天然糖蛋白的去糖基化,可能需要更多的酶及更長的反應時間;
5. EDTA、對氯丙基苯磺酸、Mn2+、Zn2+對O-Glycosidase的酶活有一定的抑制作用,1mM各物質存在條件下,酶活回收率分別為63%、60%、44%、66%%;
6. 本產品僅供研究使用,不適用于人或動的物診斷及治療用途。
此試劑盒與下游HPLC及MS兼容嗎?
是的,Rhinogen? Protein Deglycosylation Kit Ⅰ (for O-linked Glycans )所有的酶及緩沖試劑均與下游HPLC及MS應用兼容。可以采用微透析或微量過濾制備HPLC及MS分析的蛋白。