Rhinogen? O-Glycosidase是一種高度純化和非常穩定的糖苷內切酶,具有穩定性高、比活性高等特點。適用于蛋白質組學及糖生物學研究中糖蛋白上O-連寡糖鏈的有效釋放。
高純度:沒有污染蛋白酶/其它糖苷酶,純度≥95%;
高穩定性:每批Rhinogen? O-Glycosidase產品都經過嚴格的質量控制,以實現產品批間穩定性;
高比活性:有效和完全的釋放O-連聚糖。
背景:
來源于Streptococcus Pneumoniae(或Enterococcus Faecalis)的O-糖苷酶(O-Glycosidase,EC 3.2.1.97)是一類重要的糖基化研究的工具酶。Rhinogen? O-Glycosidase是將來源于Enterococcus Faecalis的O-Glycosidase基因重組并表達于大腸桿菌BL21中的重組酶,能夠將糖蛋白中Ser或Thr殘基的羥基連接的Core 1(Gal-β(1-3)-GalNAc-)及Core 3(GlcNAc-β(1-3)-GalNAc-)O-連雙糖釋放下來,如圖1。該酶對α-GalNAc結合是特異性的,但對于Ser或Thr殘基沒有明顯的偏好,同時糖蛋白的變性與否也不顯著影響O-去糖基化的效率。核心結構的任何修飾都可以阻斷O-Glycosidase的作用,最常見的修飾是核心結構的單、二或三唾液酸化。除此以外,核心結構還可能被巖藻糖,N-乙酰葡糖胺或N-乙酰半乳糖胺殘基進一步取代修飾,核心結構以外的單糖必須通過一系列外切糖苷酶依次切割,直到僅保留Core 1或Core 3二糖核心。然后O-Glycosidase才能夠完整的從Ser或Thr殘基上釋放二糖核心,如圖2。通常O-Glycosidase的使用都需要配合唾液酸酶。
圖1 Rhinogen? O-Glycosidase作用O-連二糖核心的類型
圖2 復雜O-聚糖結構的糖鏈釋放
產品包裝:
Rhinogen? O-Glycosidase包裝規格如下:
目錄號 |
規格 |
濃度 |
QPF-004-A |
1,200,000U/30μl |
40,000,000U/ml |
QPF-004-B |
5×1,200,000U/30μl |
40,000,000U/ml |
儲存體系:
QPF-004儲存在緩沖液中,以液體的形式提供。緩沖液的組成為:50 mM NaCl,20 mM Tris-HCl,1 mM EDTA,pH 7.5。
配套試劑:
Rhinogen? O-Glycosidase 配套提供的試劑如下:
試劑
成分
10×Denaturing緩沖液
5%SDS, 0.4M DTT
10×Glyco緩沖液2
0.5M Sodium Phosphate(pH7.5 at 25°C)
10%NP-40溶液
10%NP-40
產品來源:
Rhinogen? O-Glycosidase是一種將來源于Enterococcus Faecalis的O-Glycosidase基因重組并表達于大腸桿菌BL21中的重組酶,分子量大小約為147kDa。
產品質量:
SDS-PAGE分析,純度≥95%;沒有檢測到污染的外切糖苷酶、糖苷內切酶及蛋白酶活性。
產品特性:
最適反應pH為7.5;熱失活條件:65°C處理10 min。
酶活定義:
1個酶活力單位定義:在100 μl反應體系中,37°C,pH7.5條件下,1小時內從5mg唾液酸酶消化后的非變性fetuin 上催化釋放0.68nmol O-連二糖所需要的酶量。
儲存條件:
-20℃條件下,避免反復凍融。
應 用:
1.O-聚糖結構分析;
2.糖蛋白生物合成分析;
3.涉及O-聚糖的病理生理學研究;
4.治療性重組蛋白的表征及質量控制;
5.癌癥研究和異常O-糖基化的鑒定及體外診斷。
使用O-Glycosidase處理糖蛋白后,沒有看到糖鏈的去除,可能的原因?
蛋白質的糖基化修飾有N-糖基化及O-糖基化修飾,O-Glycosidase適用于釋放附著于Ser / Thr的Core 1和Core 3 O-連接的二糖核心。如果底物中確定含有O-糖鏈,請確保同時使用Neuraminidase,以釋放末端的唾液酸修飾基團。同時由于空間位阻效應(蛋白質的二級結構和三級結構)可以阻礙內切糖苷酶到達其底物作用位點,在去糖基化之前進行變性,同時按實驗操作加入NP-40溶液有助于O-連聚糖有效的釋放。如果不想變性處理,則考慮添加更多的酶或延長孵育時間。
在天然條件下釋放糖蛋白的糖鏈,需要使用多少Rhinogen? O-Glycosidase?
當蛋白質不變性時,O-Glycosidase因為空間位阻效應可能難以到達糖鏈的切割位點(因為二級和三級蛋白質結構)。添加更多的酶量及延長反應時間可能有助于糖鏈釋放效率的提高,但對于不同的糖蛋白樣品,去糖基化活性高度依賴于反應條件,建議進行適當優化或根據經驗確定最優的操作方法。
是否可以同時使用PNGase F、O-Glycosidase及α2-3,6,8,9 Neuraminidase?
是的。Rhinogen? PNGase F及O-Glycosidase采用相同的緩沖液及反應條件,而α2-3,6,8,9 Neuraminidase具有非常寬pH適用范圍(pH4.5-8.5),在PNGase F及O-Glycosidase反應體系中具有較好的活性,三者可以同時使用。